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外泌体相关基因风险模型,或可制定三阴性乳腺癌个性化治疗方案

        来势凶猛的乳腺癌,已经成为女性中最常见的恶性肿瘤。在这其中,又以三阴性乳腺癌最为令人胆寒,被称为乳腺癌之王。

 

        三阴性乳腺癌(TNBC)是一种高度异质性肿瘤,由于雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)和人表皮生长因子(Her-2)均为阴性,意味着内分泌治疗和靶向治疗对这种癌症都不管用;且有分化差、侵袭性强、更早且更易发生复发转移的特点,超过1/3的三阴性乳腺癌患者会发生复发或远处转移。复发或转移性三阴性乳腺癌通常预后较差,5年生存率不足15%,显著低于乳腺癌患者整体5年生存率(31%)。

 

(图片来源于网络)

 

        今年年初,上海交通大学医学院附属瑞金医院乳腺疾病诊治中心沈坤炜教授团队联合上海市第六人民医院,上海交通大学生物医学工程学院研究人员报道了基于三阴性乳腺癌患者外泌体的相关基因集,利用机器学习算法筛选的构建了9基因风险评分模型,并筛选了最具价值的核心基因。该研究可能有助于三阴性乳腺癌患者制定个性化治疗决策并改善其预后。相关成果以“An exosome-based specific transcriptomic signature for profiling regulation patterns and modifying tumor immune microenvironment infiltration in triple-negative breast cancer”为题发表于 Frontiers in Immunology 。

 

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        该研究首先针对 ExoCarta 数据库中的外泌体相关基因,分析了外泌体基因在肿瘤组织和正常组织中的表达情况。随后,基于 LOOCV 机器学习方法拟合了87种预测模型用于评分系统的构建,并筛选了最高的C指数结果,最终确定了9个外泌体相关基因。随后基于9个外泌体相关基因构建风险评分模型,将三阴性乳腺癌患者分为高危组与低危组,高危组与低危组显示出了OS的显著差异。

 

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        随后,该研究基于低危组与高危组的不同预后,先后分析了两组生物过程及通路的激活状态差异,免疫浸润差异,突变差异,药物敏感性差异。

 

        最后,该研究基于随机森林算法,筛选了与三阴性乳腺癌患者预后最相关的外泌体相关基因:CLDN7,并进行了相关的实验验证。结果显示,CLDN7 高表达外泌体促进了三阴性乳腺癌细胞的迁移与侵袭性;同时,109位三阴性乳腺癌患者的组织微阵列结果显示,CLDN7 高表达的 TNBC 患者 RFS 较差。

 

        总之,该研究基于外泌体相关基因集构建了 TNBC 的风险评分模型,将患者分为高风险组和低风险组。检测患者的外泌体相关基因可能成为未来预测 TNBC 预后的方法。CLDN7 可以作为 TNBC 人群的预后生物标志物。该研究有助于更好地理解外泌体相关基因与 TNBC 预后的关系,为 TNBC 的临床诊断和治疗提供新思路。

 

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